A segurança da proloterapia depende em grande parte da experiência e formação do médico que realiza o procedimento. Quando realizada por médicos com conhecimento e experiência prática suficientes, a proloterapia é geralmente um método seguro. No entanto, como em qualquer procedimento que envolve a injeção de uma substância numa articulação, existem riscos potenciais. Estes possíveis efeitos secundários podem incluir: Dor e rigidez no local da injeção, sangramento, hematomas e inchaço, infeção, reações alérgicas.