स्पाइना बिफिडा से जुड़े संभावित जोखिम कारक स्थिति के प्रकार और गंभीरता से निकटता से संबंधित हैं। प्रमुख संभावित जटिलताओं में शामिल हैं:

1. हाइड्रोसेफलस: स्पाइना बिफिडा वाले शिशुओं में हाइड्रोसेफलस का विकास एक महत्वपूर्ण चिंता का विषय है।
2. सेरिबेलर हर्निएशन (चियारी मालफॉर्मेशन): स्पाइना बिफिडा की जटिलता के रूप में सेरिबेलर हर्निएशन हो सकता है।
3. संक्रमण का जोखिम: रीढ़ की हड्डी के खुलने के सर्जिकल बंद होने से पहले या बाद में संक्रमण विकसित होने का जोखिम होता है। ऐसे संक्रमण रोगी की समग्र स्थिति को काफी खराब कर सकते हैं।