पल्मोनरी एम्बोलिज्म का इलाज आमतौर पर कम से कम छह महीने तक चलता है। स्थिति की गंभीरता के आधार पर, इलाज के एक हिस्से के लिए अस्पताल में भर्ती होने की आवश्यकता हो सकती है। उन मामलों में जहां प्रोटीन सी की कमी, फैक्टर V लीडेन म्यूटेशन, या एंटीथ्रोम्बिन III की कमी जैसी आनुवंशिक प्रवृत्तियां मौजूद हैं, रोगी को जीवन भर एंटीकोएगुलेंट दवा का उपयोग करना पड़ सकता है।