पल्मोनरी एम्बोलिज्म दोबारा हो सकता है यदि अंतर्निहित जोखिम कारकों को ठीक नहीं किया जाता है और उपचार का ठीक से पालन नहीं किया जाता है। एक नया थक्का बनने से रोकने के लिए, आमतौर पर कम से कम 6 महीने के लिए रक्त-पतला करने वाली (एंटीकोएगुलेंट) दवाएं इस्तेमाल की जाती हैं। उपचार का पूर्ण पालन और नियमित डॉक्टर चेक-अप रोग के दोबारा होने के जोखिम को काफी कम कर देता है।