एंडोमेट्रियोसिस उन महिलाओं में बांझपन का एक महत्वपूर्ण कारण हो सकता है जिन्हें गर्भधारण करने में कठिनाई होती है। कुछ मामलों में, एंडोमेट्रियोसिस के कारण बनने वाले निशान ऊतक (आसंजन) फैलोपियन ट्यूब में रुकावट पैदा कर सकते हैं, जिससे गर्भावस्था रुक ​​सकती है। हालांकि, अधिकांश महिलाओं में, एंडोमेट्रियोसिस प्रजनन क्षमता को कैसे प्रभावित करता है, इसके सटीक तंत्र अभी तक पूरी तरह से समझे नहीं गए हैं।

वे तंत्र जिनके द्वारा एंडोमेट्रियोसिस बांझपन में योगदान कर सकता है, उनमें शामिल हैं:
अंडाशय रिजर्व में कमी: यह अंडाशय में अंडे की संख्या (अंडाशय रिजर्व) को कम कर सकता है।
ओव्यूलेशन संबंधी शिथिलता: यह नियमित ओव्यूलेशन को बाधित कर सकता है।
फैलोपियन ट्यूब में रुकावट: यह ट्यूबों में रुकावट पैदा कर सकता है, जिससे शुक्राणु और अंडे का मिलन रुक ​​सकता है।
विषाक्त पदार्थों का उत्पादन: यह प्राकृतिक विषाक्त पदार्थों के उत्पादन का कारण बन सकता है जो शुक्राणु को प्रतिकूल रूप से प्रभावित कर सकते हैं या भ्रूण को नुकसान पहुंचा सकते हैं।
प्रत्यारोपण विफलता: यह भ्रूण को गर्भाशय की दीवार में प्रत्यारोपित होने से रोक सकता है।
भ्रूण के विकास पर नकारात्मक प्रभाव: यह भ्रूण के स्वस्थ विकास को बाधित कर सकता है।