A endometriose pode ser uma causa significativa de infertilidade em mulheres que têm dificuldade em conceber. Em alguns casos, o tecido cicatricial (aderências) causado pela endometriose pode levar a bloqueios nas trompas de Falópio, impedindo a gravidez. No entanto, na maioria das mulheres, os mecanismos exatos pelos quais a endometriose afeta a fertilidade ainda não são totalmente compreendidos.

Os mecanismos pelos quais a endometriose pode contribuir para a infertilidade incluem:
Redução da reserva ovárica: Pode diminuir o número de óvulos nos ovários (reserva ovárica).
Disfunção ovulatória: Pode perturbar a ovulação regular.
Obstrução das trompas de Falópio: Pode causar bloqueios nas trompas, impedindo a união do espermatozoide e do óvulo.
Produção de toxinas: Pode levar à produção de toxinas naturais que podem afetar negativamente os espermatozoides ou prejudicar o embrião.
Falha de implantação: Pode impedir que o embrião se implante na parede uterina.
Impacto negativo no desenvolvimento embrionário: Pode prejudicar o desenvolvimento saudável do embrião.