कावासाकी रोग का निदान पांच दिनों से अधिक समय तक रहने वाले, एंटीबायोटिक उपचार के प्रति अनुत्तरदायी उच्च बुखार के साथ-साथ निम्नलिखित पांच नैदानिक ​​निष्कर्षों में से कम से कम चार की उपस्थिति के आधार पर किया जाता है:
* मौखिक श्लेष्मा में परिवर्तन (फटे होंठ, स्ट्रॉबेरी जीभ का दिखना)
* दोनों आँखों में कंजंक्टिवल लालिमा या बिना पस का कंजंक्टिवाइटिस
* धड़ और कमर के क्षेत्र पर दाने
* गर्दन में एकतरफा लिम्फ नोड का बढ़ना (लिम्फैडेनोपैथी)
* हाथों और पैरों में सूजन या लालिमा
जब इन लक्षणों के साथ कावासाकी रोग का संदेह होता है, तो एक विस्तृत शारीरिक परीक्षण, रक्त और मूत्र परीक्षण, और सबसे महत्वपूर्ण रूप से, एक बाल रोग विशेषज्ञ हृदय रोग विशेषज्ञ द्वारा की गई इकोकार्डियोग्राफी के माध्यम से निश्चित निदान किया जाता है।