बोटॉक्स का उपयोग मांसपेशियों के संकुचन को रोकने की अपनी क्षमता के कारण अचलासिया के उपचार में एक अस्थायी विकल्प के रूप में किया जा सकता है। हालांकि, बोटॉक्स इंजेक्शन का प्रभाव अल्पकालिक होता है, यह स्थायी इलाज प्रदान नहीं करता है और नियमित दोहराव की आवश्यकता होती है। बार-बार उपयोग से अन्नप्रणाली के निचले हिस्से में रेशेदार ऊतक का विकास हो सकता है। इन कारकों को ध्यान में रखते हुए, अचलासिया के उपचार में बोटॉक्स को आमतौर पर प्राथमिक पसंदीदा विधि नहीं माना जाता है।