L'application de botox peut être utilisée comme option temporaire dans le traitement de l'achalasie en raison de sa capacité à inhiber les contractions musculaires. Cependant, l'effet des injections de botox est de courte durée, n'apporte pas de guérison permanente et nécessite des répétitions régulières. Des applications répétées peuvent entraîner le développement de tissus fibreux dans la partie inférieure de l'œsophage. Compte tenu de ces facteurs, le botox n'est généralement pas considéré comme une méthode de choix primaire dans le traitement de l'achalasie.