Lorsqu'un patient se présente à l'hôpital avec des symptômes suggérant le choléra, un examen physique est effectué par un médecin. Pour confirmer le diagnostic de choléra de manière définitive, un échantillon de selles (matières fécales) est prélevé sur le patient et envoyé à un laboratoire. L'échantillon de selles collecté est ensuite examiné sous un microscope spécialisé. Si la bactérie Vibrio cholerae est identifiée lors du test des selles, un diagnostic de choléra est posé et un plan de traitement est ensuite élaboré. Le diagnostic précoce de la maladie augmente considérablement les chances de succès du traitement.