La première étape du traitement de fécondation in vitro est la préparation de la femme. Cette préparation peut se faire de deux manières : soit par un protocole long (long), débutant le 21e jour du cycle menstruel et aboutissant à la ponction ovocytaire après environ 3 à 3,5 semaines, soit par un protocole court (antagoniste), débutant le 2e ou 3e jour du cycle menstruel et aboutissant à la ponction ovocytaire après environ 10 à 12 jours. Le transfert des embryons ainsi obtenus dans l’utérus se fait, selon les conditions particulières de la patiente et les habitudes du médecin, soit frais (au même moment que la ponction ovocytaire), soit par congélation-décongélation (les embryons sont d’abord congelés et stockés, puis implantés ultérieurement à un moment jugé opportun par le médecin).