Le système de neuronavigation est principalement utilisé dans les procédures chirurgicales suivantes au sein de la Neurochirurgie (Chirurgie du Cerveau, des Nerfs et de la Moelle Épinière) :

* Chirurgies des tumeurs cérébrales
* Chirurgies des hémorragies intracrâniennes
* Traitement chirurgical des maladies cérébrovasculaires, telles que les malformations artério-veineuses (MAV)
* Chirurgies de stimulation cérébrale profonde (SCP) pour la maladie de Parkinson et des affections similaires avec tremblements
* Chirurgies rachidiennes et placement précis d'implants (vis, tiges, etc.) dans la colonne vertébrale
De plus, le système de neuronavigation peut également être utilisé dans certaines procédures chirurgicales orthopédiques.