Le traitement de la paralysie diaphragmatique débute par une évaluation complète de l'état de santé général du patient, de l'impact de la dyspnée sur sa qualité de vie, et des causes sous-jacentes de la paralysie. Si une cause primaire à l'origine de la paralysie est identifiée, le traitement se concentre principalement sur l'élimination de cette cause. Pour les paralysies diaphragmatiques unilatérales, une plication diaphragmatique (resserrement chirurgical du dôme diaphragmatique) peut être effectuée. Dans les cas de paralysie diaphragmatique bilatérale, si les résultats de l'EMG du nerf phrénique indiquent que les nerfs sont intacts, la thérapie par stimulateur diaphragmatique peut être envisagée. Cette méthode consiste généralement à placer deux électrodes sur chaque diaphragme. Ces électrodes sont acheminées hors de la région abdominale et connectées à un appareil stimulateur. L'appareil envoie des impulsions électriques aux muscles du diaphragme à intervalles réguliers, provoquant leur contraction et leur permettant ainsi de participer mécaniquement à la respiration. Pour les patients qui n'obtiennent pas un soutien respiratoire suffisant malgré toutes les interventions chirurgicales, une assistance respiratoire par ventilateur mécanique peut être nécessaire pour maintenir la respiration.