Le traitement de la colite varie en fonction de la cause et du type de la maladie. Les principales méthodes de traitement de la colite sont les suivantes :

Traitement de la colite pseudomembraneuse :
* Arrêt du médicament responsable.
* Utilisation d'antibiotiques contre la bactérie Clostridium difficile en cas de non-amélioration des symptômes.
* Médicaments différents ou chirurgie dans les cas récurrents.
* Ajustements alimentaires pour prévenir la récidive : consommation abondante de liquides, évitement des boissons caféinées et alcoolisées, choix d'aliments faciles à digérer, augmentation du nombre de repas et évitement des aliments épicés/gras.

Traitement de la colite ischémique :
* Régime liquide, surveillance, antibiotiques et traitement ambulatoire dans les cas légers.
* Médicaments vasodilatateurs.
* Médicaments thrombolytiques en cas de coagulation sanguine.
* Chirurgie en cas de non-réponse au traitement.
* Traitement prioritaire de l'insuffisance cardiaque sous-jacente ou d'autres affections.
* Arrêt des médicaments pour la migraine, les hormones et certains médicaments cardiaques.
* Chirurgie en cas de perforation du côlon, d'obstruction ou de nécrose tissulaire.

Traitement de la colite spasmodique :
* Gestion du stress et stratégies de lutte contre le stress.
* Médicaments contre la constipation et la diarrhée (pas d'antibiotiques).

Traitement de la colite microscopique :
* Guérison spontanée dans la plupart des cas.
* Traitement avec régime alimentaire et médicaments anti-diarrhéiques dans de rares cas.

Traitement de la colite radique :
* Disparaît spontanément après la fin de la radiothérapie.

Traitement de la colite ulcéreuse :
* Traitement médicamenteux : Antibiotiques, immunosuppresseurs et agents biologiques pour réduire l'inflammation et le gonflement. Médicaments pour les symptômes tels que la diarrhée, les saignements et les douleurs abdominales, ainsi que des médicaments pour réduire la fréquence des poussées.
* Traitement chirurgical : Ablation du côlon chez les patients ne répondant pas au traitement médicamenteux ou présentant des symptômes sévères.
* Régime alimentaire : Les régimes visant à réduire les symptômes peuvent être modifiés au fil du temps. Suppléments nutritionnels (sous contrôle médical) pour prévenir la déshydratation, le déséquilibre électrolytique et la malnutrition dus à la diarrhée et aux saignements. Des régimes hypercaloriques, sans lactose, faibles en gras, faibles en fibres, faibles en sodium ou sans gluten sont déterminés en fonction de la condition du patient.