El síndrome de malabsorción, también conocido como trastorno de la absorción, puede surgir como resultado de diversas enfermedades y condiciones. Entre las principales causas se encuentran la enfermedad celíaca, enfermedades inflamatorias intestinales como la enfermedad de Crohn, trastornos intestinales relacionados con la radioterapia, la enfermedad de Whipple, la fibrosis quística, la insuficiencia pancreática debido a traumatismos o alcohol, y las infecciones parasitarias o por lombrices intestinales.