Antes del procedimiento, los pacientes reciben información verbal detallada y firman formularios de consentimiento por escrito. El área de la biopsia se evalúa mediante ecografía o tomografía computarizada (TC). Luego, el sitio del procedimiento se desinfecta con un antiséptico y se prepara un campo estéril. Se administra anestesia local para adormecer el área relevante. Bajo la guía de ecografía o TC en tiempo real, una aguja de biopsia de corte, típicamente de 1 a 4 mm de diámetro, se avanza hacia el tejido objetivo. Una vez en posición, se activa el mecanismo de disparo de la aguja y una pequeña cuchilla interna se extiende rápidamente para extirpar una muestra de tejido. Esta muestra de tejido se coloca cuidadosamente en un recipiente que contiene un fijador patológico especial. Este proceso se repite varias veces desde diferentes partes de la lesión para asegurar una toma de muestras adecuada. El procedimiento concluye después de que un patólogo, presente en la sala, confirma la idoneidad de las muestras recolectadas. Este es un procedimiento ambulatorio, y su duración suele oscilar entre 15 y 30 minutos.