Die Botox-Anwendung kann aufgrund ihrer Fähigkeit, Muskelkontraktionen zu hemmen, als temporäre Option bei der Behandlung von Achalasie eingesetzt werden. Die Wirkung von Botox-Injektionen ist jedoch kurzlebig, bietet keine dauerhafte Heilung und erfordert regelmäßige Wiederholungen. Wiederholte Anwendungen können zur Entwicklung von fibrotischem Gewebe im unteren Teil der Speiseröhre führen. Angesichts dieser Faktoren wird Botox im Allgemeinen nicht als primär bevorzugte Methode bei der Behandlung von Achalasie angesehen.