Die primäre Behandlung niedriger Amylasewerte besteht in der genauen Diagnose und Behandlung der zugrunde liegenden Ursache. Während dieses Prozesses kann zur symptomatischen Linderung unter ärztlicher Aufsicht eine Einschränkung der Kohlenhydratzufuhr und die Einnahme von Medikamenten, die Pankreasenzymersatzpräparate enthalten, in Betracht gezogen werden.