Sıvı azot kriyoterapisi, kötü huylu kemik tümörü tanısı konmuş tüm hastalar için uygun değildir. Tedavinin uygulanması genellikle aşağıdaki senaryolarda kontrendikedir veya daha az etkilidir:
* Bitişik bir ekleme uzanmış tümörler.
* Vücudun diğer bölgelerine metastaz yapmış tümörler.
* Kritik nörovasküler yapıları tamamen sarmış tümörler.
* Tedavi ayrıca, önceki kemoterapi veya radyoterapiye yanıt vermeyen tümörlerde de düşük etkinlik göstermektedir.