Her Wilms tümörü ameliyatında olduğu gibi, kanama, büyük kan damarlarına veya diğer organlara zarar verme veya anestezi reaksiyonları gibi komplikasyonlar ortaya çıkabilir. Uzman cerrahlar tarafından yapılan Wilms tümörü ameliyatlarında bu komplikasyonların görülme olasılığı çok düşük olsa da, ameliyatın olası riskleri arasındadır.

Ameliyattan sonra ağrı yaşanabilir, ancak bu ağrılar ilaçlarla kontrol edilebilir.

Wilms tümörü ameliyatından sonra nadiren iç kanama, kan pıhtılaşması ve enfeksiyon gibi riskler vardır. Bunlar, genel cerrahi işlemlerin bilinen riskleridir.

Her iki böbrekte tümör varsa, böbreklerin tamamen alınması diyaliz veya böbrek nakli gerektirebilir.