Yemek borusunda çok çeşitli hastalıklar görülebilmektedir. Bunlar başlıca; boyun, göğüs içi yemek borusu ve mide girişindeki tümörler, Zenker, midtorasik veya epifrenik divertiküller gibi kese benzeri oluşumlar, midenin üçte birinden fazlasının göğüs boşluğuna girdiği büyük herniler, akalazya ve özofagus spazmı gibi hareket bozuklukları, yemek borusu darlıkları, yanıkları, yırtıkları ve trakeoözofajiyal fistül gibi durumları kapsamaktadır.