Komünike hidrosellerin çoğu bir yaşına kadar kendiliğinden düzelme eğilimindedir. Bu nedenle, operasyon genellikle bir yaşından sonra, iletişim kanalı (patent processus vaginalis) kapanmamış çocuklarda planlanır. Kordon kistinin kendiliğinden düzelmesi ise çok nadirdir. Kasık kanalındaki oluşumlar üzerinde baskı oluşturması ve enfeksiyon riski taşıması nedeniyle kordon kistleri için cerrahi müdahale genellikle önerilir. Bu elektif cerrahiler için, çocuğun ameliyata uygun gelişimsel olgunluğa ulaşmasını sağlamak amacıyla genellikle bir yaşın geçilmesi beklenmesi tavsiye edilir.
Hem kordon kisti hem de hidrosel için cerrahi prosedür, kasık kıvrımının hemen üzerinde, karnın alt kısmında yaklaşık 1-2 cm'lik küçük bir kesi ile başlar. Bu kesi aracılığıyla patent processus vaginalis (hidroseller ve kordon kistleriyle ilişkili açık kanal) tespit edilir ve spermatik kord (vas deferens ve testise giden damarları içeren) dahil olmak üzere çevre dokulardan dikkatlice ayrılır. Kese daha sonra kasık kanalının üst kısmından emilebilir dikişlerle bağlanır, böylece karın boşluğu ile skrotum/kordon arasındaki sıvı akışı etkili bir şekilde engellenir. Kesenin içinde organ bulunursa ve hasarsız ise, bağlama işleminden önce dikkatlice karın boşluğuna geri itilir. Ameliyat tipik olarak 30 ila 60 dakika sürer. Genellikle günübirlik bir işlem olarak gerçekleştirilir; çocuklar aynı gün evlerine dönebilir ve kısa süre sonra günlük aktivitelerine devam edebilirler. Uygun görüldüğü ve önceden planlandığı takdirde, eş zamanlı olarak sünnet de yapılabilir.
Testis etrafında gergin durumda olan komünike olmayan hidroseller için daha erken cerrahi müdahale düşünülebilir. Abdominoskrotal hidroseller ise tanı konulduğu anda cerrahi olarak tedavi edilmelidir. Konjenital hidrosellerin iğne aspirasyonu ile boşaltılmasının son derece tehlikeli bir yaklaşım olduğunu belirtmek önemlidir; bu yöntem enfeksiyon riskini taşır ve potansiyel olarak bebeğin testisinin kaybına yol açabilir.