Ekokardiyografi uygulaması sırasında hasta genellikle sol yanına yatırılır. Göğüs kafesine özel bir jel sürüldükten sonra, transdüser adı verilen cihaz kalp bölgesinde nazikçe hareket ettirilir. Bu işlem, X-ray radyasyonu içermeyen bir ultrason teknolojisidir. Genellikle ağrısız olup, hastalarda bilinen herhangi bir yan etkiye yol açmaz. Ekokardiyografi cihazının ekranında kalbin yapısal ve fonksiyonel tüm detayları gerçek zamanlı olarak görüntülenebilir. Elde edilen tüm bulgular, işlemi gerçekleştiren kardiyoloji uzmanı tarafından titizlikle değerlendirilir.