Nöronavigasyon kullanılacak ameliyatlarda, standart ameliyat öncesi hazırlıkların dışında ek bir hazırlık gerekmez. Ameliyat öncesinde, ameliyat edilecek bölgenin ileri düzey Manyetik Rezonans (MR) veya Bilgisayarlı Tomografi (BT) görüntüleri alınır. Elde edilen üç boyutlu görüntüler, ameliyat sırasında kullanılan Nöronavigasyon cihazına yüklenir. Hasta ameliyathaneye alındıktan sonra, deri yüzeyinde gezdirilen bir prob yardımıyla cerrahi alan üç boyutlu olarak bilgisayara aktarılır. Bu yöntem, cerrahi ekibe ameliyat bölgesine ulaşmak için en kısa ve güvenli yolu gösteren bir harita sağlar. Hastanın üç boyutlu radyolojik görüntülerini işleyen nöronavigasyon cihazı, beyin veya omurilikteki riskli bölgeleri göstererek cerrahın sadece sorunlu bölgede çalışmasını ve çevredeki sağlıklı dokulara zarar vermesini engeller.