Diz protezi ameliyatı ve kök hücre tedavisi birbirinden farklı amaçlara hizmet eder ve genellikle birbirinin yerine geçen tedavi alternatifleri olarak kabul edilmez. Kök hücre tedavisi, 60 yaş üzeri hastalara genellikle önerilmez; zira bu demografide yeterli sayıda ve kalitede kök hücre elde etmek önemli ölçüde zorlaşmaktadır. Diz protezi gerektiren hastalar genellikle diz ekleminin birden fazla bileşenini etkileyen yaygın hasar ile başvurur. Buna karşılık, kök hücre uygulamaları genellikle kıkırdak hasarının dizin belirli bir bölümüyle sınırlı olduğu, diğer eklem yapılarının sağlıklı kaldığı durumlarda tercih edilir. Kök hücre tedavisinin temel terapötik prensipleri, diz protezinin prensiplerinden önemli ölçüde farklıdır. Diz protezi ameliyatı olamayacak hastalar için hyaluronik asit gibi belirli enjeksiyonlar bir seçenek olabilse de, bu senaryolarda kök hücre tedavisi genellikle tercih edilen bir yöntem değildir. Kök hücre tedavisi, sınırlı kıkırdak kusurları için en uygunken, diz protezi için uygun görülen hastalarda yaygın eklem ve kıkırdak dejenerasyonu görülür.