Anizokori tanısı bir göz hastalıkları uzmanı (oftalmolog) tarafından göz muayenesi ile konulur. Teşhis sürecinde, semptomların değerlendirilmesi ve altta yatan nedeni belirlemek amacıyla ek testler istenebilir. Muayene sırasında, pupillerin daha iyi değerlendirilmesini sağlamak için göz damlası kullanılabilir. Anizokorinin nedenini detaylı bir şekilde araştırmak için aşağıdaki ileri tetkikler uygulanabilir: Manyetik Rezonans (MR) Görüntüleme, Bilgisayarlı Tomografi (BT) Taraması, Röntgen, Tam Kan Sayımı.