Kolposkopik inceleme sırasında şüpheli lezyonlar tespit edildiğinde, tanısal amaçla kolposkopik biyopsi uygulanır. Bu işlem, özel bir biyopsi pensi kullanılarak gerçekleştirilir. Gerekirse, şüpheli bölgelerin sayısına bağlı olarak birden fazla yerden doku örneği alınabilir. Alınan parçaların, doğru ve güvenilir bir patolojik inceleme için yeterli büyüklükte ve kalitede olması büyük önem taşır.