Ampütasyon cerrahi bir işlemdir ve ameliyathane koşullarında gerçekleştirilir. Uygulanacak anestezi yöntemi, ampütasyonun yapılacağı uzvun yerine ve hastanın genel sağlık durumuna göre belirlenir. Örneğin, kol veya el ampütasyonları genellikle genel anestezi altında yapılırken, bazı parmak ampütasyonları lokal anestezi ile de gerçekleştirilebilir. Bacak veya ayak ampütasyonlarında ise genel anestezi ya da spinal anestezi (belden aşağısının uyuşturulması) tercih edilebilir.

Hasta, ameliyat öncesinde genellikle 8 saat süreyle katı ve sıvı gıda alımını durdurmalıdır. Ameliyathaneye alınmadan önce, ampüte edilecek uzuv cerrah tarafından işaretlenir ve kesim seviyesi netleştirilir. Ameliyathanede, hasta hazırlandıktan sonra planlanan bölgeden uzvun kesimi gerçekleştirilerek işlem tamamlanır.