Karaciğer biyopsisi için hasta sırtüstü pozisyonda yatırılır. İşlem yapılacak bölge antiseptik solüsyon ile sterilize edilir ve iğnenin giriş noktasına lokal anestezi uygulanır. İğnenin rahat ilerlemesini sağlamak amacıyla ciltte küçük bir insizyon yapılabilir. İşlem boyunca iğnenin karaciğer içindeki ilerleyişi ve konumu, radyolojik görüntüleme (örneğin, ultrason veya BT) eşliğinde dikkatle takip edilir. Görüntüleme rehberliğinde yapılan biyopsiler yüksek doğruluk ve güvenlik sunar. Genellikle kaburgalar arasından ilerletilen özel bir biyopsi iğnesi ile karaciğerden doku örneği alınır.