Omfalosel, karın duvarının doğuştan gelen bir kapanma defektidir. Bu durumda, bağırsaklar ve bazen karın içindeki diğer organlar, karın duvarı açıklığından dışarı çıkarak, amniyon kesesi ile örtülü bir kese içinde göbeğin dışında yer alır. Normal fetal gelişimde, gebeliğin 6. ila 10. haftaları arasında bağırsaklar karın dışına, göbek kordonu içine doğru geçici olarak uzar. Genellikle 11. gebelik haftasında bu bağırsaklar karın boşluğuna geri döner. Omfalosel, bağırsakların bu normal geri dönüşünün gerçekleşmemesi sonucu meydana gelir. Bu durum, yalnızca bağırsakların veya bağırsaklarla birlikte karın içindeki diğer organların (örneğin karaciğer) karın dışına çıkmasıyla görülebilir.