Anne adaylarında görülen belirli durumlar ve hastalıklar, bebeklerinde doğumsal kalp anomalisi riskini artırabilir. Bu riski yükselten başlıca faktörler şunlardır:

* Maruziyetler: Annenin teratojenik ajanlara (ilaçlar, kimyasallar), belirli enfeksiyonlara (özellikle gebeliğin ilk üç ayında kızamıkçık, sitomegalovirüs gibi) veya yüksek doz iyonize radyasyona maruz kalması. Aşırı alkol tüketimi de risk faktörüdür.
* Mevcut Tıbbi Durumlar:
* Kontrolsüz Diyabet: Diyabetin erken dönemde etkili bir şekilde yönetilememesi, doğumsal kalp hastalığı riskini %0.6-0.8'den %4-6'ya çıkarabilir.
* Fenilketonüri (PKU): Fenilketonüri hastası annelerin bebeklerinde bu risk %14'e kadar çıkabilmektedir.
* Bağ Doku Hastalıkları: Annenin bağ dokusu hastalıklarına sahip olması.
* Aile Öyküsü: Özellikle anne tarafında doğumsal kalp hastalığı öyküsünün bulunması.