Yarım asır önce tanımlanmış olmasına rağmen, Kawasaki hastalığının kesin nedenleri tam olarak anlaşılamamıştır. Bununla birlikte, gözlemlenen verilere dayanarak belirli risk faktörleri belirlenmiştir: Genetik Yatkınlık: Genetik yatkınlığı olan çocuklarda daha sık görülür. Yaş: Kawasaki hastalığı vakalarının yaklaşık %85'i beş yaşın altındaki çocuklarda görülür. Cinsiyet: Erkek çocuklar, kız çocuklarına göre 1,5 kat daha yüksek risk altındadır. Etnik Köken: Dünya genelinde yaygın olmasına rağmen, Kawasaki hastalığı Asya kökenli bireylerde daha sık görülür.