Эндометриомы, часто называемые шоколадными кистами, как правило, не рассасываются самопроизвольно. Наиболее эффективным методом лечения является хирургическое удаление. Хотя некоторые лекарства могут помочь справиться с симптомами и замедлить рост кист, они обычно не устраняют сами кисты. В случаях разрыва кисты ее содержимое может попасть в брюшную полость. Однако, если стенка кисты не удалена полностью, риск рецидива остается значительно высоким.