Болезнь Педжета может влиять на электролитный баланс организма, особенно на уровень кальция. Поскольку заболевание также затрагивает вторичные структуры, связанные с костями, могут возникнуть различные осложнения. Эти осложнения могут включать мышечные судороги, спазмы и нарушение функции печени. Реже, но потенциально серьезно, могут возникать такие проблемы, как неврологические расстройства, сердечная недостаточность и некоторые виды рака.