Não existe um tratamento específico para a Doença Mão-Pé-Boca. O tratamento foca-se no alívio dos sintomas, que geralmente se resolvem por si próprios dentro de 7 a 10 dias. Para aliviar a dor causada pelas feridas na boca, podem ser utilizados anestésicos orais tópicos, juntamente com analgésicos e antipiréticos.
Para apoiar o processo de recuperação, é importante aumentar a ingestão de líquidos e seguir uma dieta rica em fibras e probióticos. As crianças doentes devem repousar durante todo o período da doença. Para crianças com quatro anos ou mais, também podem ser considerados remédios fitoterápicos, como chá de tília ou chá de sálvia.
Para ajudar a criança a sentir-se mais confortável e a reduzir a gravidade dos sintomas, deve-se evitar alimentos e bebidas excessivamente quentes, e dar preferência a alimentos moles. É benéfico evitar frutas cítricas e bebidas ácidas como refrigerantes para não irritar as bolhas dolorosas na boca. Além disso, enxaguar a boca com água salgada morna também pode proporcionar alívio à criança. Esta doença é uma infeção viral comum em crianças.