फाटे होंठ और तालु का निदान अक्सर जन्म के समय एक व्यापक शारीरिक परीक्षण के माध्यम से किया जा सकता है। होंठ या तालु में एक दृश्यमान दरार आमतौर पर जन्म के समय तुरंत स्पष्ट होती है। हालांकि गर्भावस्था के दौरान विस्तृत प्रसवपूर्व अल्ट्रासाउंड कभी-कभी फाटे होंठ का पता लगा सकता है, माइक्रोफॉर्म जैसे कुछ कम स्पष्ट रूपों को जन्म से पहले पहचानना चुनौतीपूर्ण हो सकता है। हालांकि, जन्म के बाद, शिशु की शारीरिक उपस्थिति के आधार पर आमतौर पर एक स्पष्ट निदान किया जा सकता है।

फाटे होंठ और फाटा तालु विभिन्न तरीकों से प्रकट हो सकते हैं:
* होंठ और/या मुंह के ऊपरी हिस्से (तालु) में एक दरार जो चेहरे के एक या दोनों तरफ को प्रभावित करती है।
* होंठ पर एक छोटा सा निशान या नोक, या एक अधिक व्यापक दरार जो होंठ से ऊपरी मसूड़े और तालु के माध्यम से नाक के आधार तक फैली हुई है।
* तालु में एक दरार जो चेहरे की उपस्थिति को स्पष्ट रूप से प्रभावित नहीं करती है।

कम सामान्यतः, एक दरार केवल मुंह के पिछले हिस्से में नरम तालु की मांसपेशियों में हो सकती है, जो मौखिक अस्तर (सबम्यूकोसल फाटा तालु) से ढकी होती है। इस प्रकार की दरारें अक्सर जन्म के समय स्पष्ट नहीं होती हैं। सबम्यूकोसल फाटा तालु के संकेत और लक्षणों में शामिल हो सकते हैं:
* खिलाने में कठिनाई
* निगलने में कठिनाई, जिससे तरल पदार्थ या भोजन संभावित रूप से नाक से बाहर निकल सकते हैं
* नाक से बोलने वाली आवाज
* बार-बार होने वाले कान के संक्रमण