कोलोनोस्कोपी के बाद, मरीजों को लगभग 1 घंटे तक अस्पताल में निगरानी में रखा जाता है। आमतौर पर उन्हें प्रक्रिया के उसी दिन घर भेज दिया जाता है। चूंकि शामक दवाओं का उपयोग किया जाता है, इसलिए मरीज के साथ एक साथी का होना महत्वपूर्ण है। कोलोनोस्कोपी के दिन, गाड़ी चलाने, महत्वपूर्ण निर्णय लेने और काम पर लौटने से बचना चाहिए। प्रक्रिया के कुछ घंटों के भीतर, आंतों में हवा के कारण सूजन और गैस का दर्द हो सकता है। टहलने से इन परेशानियों को कम करने में मदद मिल सकती है। भारी सामान उठाने या ज़ोरदार शारीरिक गतिविधियों से बचना चाहिए। कोलोनोस्कोपी के बाद मल में थोड़ी मात्रा में रक्त दिखना आमतौर पर सामान्य माना जाता है और यह चिंता का कारण नहीं होता है। हालांकि, यदि रक्तस्राव जारी रहता है या बिगड़ जाता है, तो आपको तुरंत अपने डॉक्टर से संपर्क करना चाहिए। दैनिक गतिविधियों को पूरी तरह से फिर से शुरू करने से पहले आमतौर पर एक दिन इंतजार करने की सलाह दी जाती है। सामान्य आहार फिर से शुरू किया जा सकता है; हालांकि, यदि कोलोनोस्कोपी के दौरान बायोप्सी ली गई थी या कोई पॉलीप हटाया गया था, तो आपका डॉक्टर एक विशेष आहार की सलाह दे सकता है। पर्याप्त तरल पदार्थ का सेवन ठीक होने की प्रक्रिया के लिए महत्वपूर्ण है। रक्त-पतला करने वाली दवाएं लेने वाले रोगियों को चिकित्सकीय सलाह पर इन दवाओं को अस्थायी रूप से बंद करने के लिए कहा जा सकता है। हालांकि, डॉक्टर की सिफारिश के बिना कोई भी दवा बंद नहीं करनी चाहिए।