पेचिश के उपचार में मुख्य रूप से तरल पदार्थ की कमी को पूरा करने के लिए पुनर्जलीकरण पर ध्यान केंद्रित किया जाता है, जो अत्यंत महत्वपूर्ण है। मौखिक पुनर्जलीकरण समाधान (ओआरएस) को आमतौर पर प्राथमिकता दी जाती है। हालांकि, गंभीर निर्जलीकरण के मामलों में, खासकर यदि रोगी गंभीर मतली और उल्टी के कारण पर्याप्त तरल पदार्थ और भोजन मौखिक रूप से लेने में असमर्थ है, तो शुरुआती तौर पर अंतःशिरा (IV) तरल पदार्थ देना आवश्यक हो सकता।

पेचिश के गंभीर रूपों के लिए, उपचार में तरल पदार्थ प्रबंधन के अलावा विशिष्ट सूक्ष्मजीवी रोगजनक को लक्षित करने वाली थेरेपी भी शामिल होती है। अमीबिक पेचिश का इलाज अमीबा को खत्म करने के लिए मेट्रोनिडाज़ोल जैसे परजीवी-रोधी दवाओं से किया जाता है। बेसिलरी पेचिश में, शिगेला बैक्टीरिया के खिलाफ प्रभावी एंटीबायोटिक्स निर्धारित की जाती हैं। यह ध्यान रखना महत्वपूर्ण है कि पेचिश के उपचार में आमतौर पर दस्त-रोधी दवाओं की सलाह नहीं दी जाती है। एंटीबायोटिक थेरेपी की आवश्यकता एक चिकित्सक द्वारा निर्धारित की जाएगी, क्योंकि कुछ मामले उनके बिना भी ठीक हो सकते हैं।