एन्जलमैन सिंड्रोम में, जन्म से पहले और जन्म के दौरान का विकास सामान्य होता है। निदान व्यापक नैदानिक ​​मूल्यांकन, विस्तृत पारिवारिक इतिहास और विशिष्ट विशेषताओं की पहचान पर आधारित होता है। आनुवंशिक परीक्षण लगभग 90% मामलों में निदान की पुष्टि करते हैं। लगभग 80% मामलों की पुष्टि डीएनए मेथिलिकरण विश्लेषण जैसे रक्त परीक्षणों के माध्यम से की जाती है। ये परीक्षण एन्जलमैन सिंड्रोम से संबंधित महत्वपूर्ण क्षेत्र (विशेष रूप से गुणसूत्र 15q11-q13) में विलोपन और यूनिपैरेंटल डिसोमी का पता लगा सकते हैं। FISH या माइक्रोएरे विश्लेषण जैसे तरीके भी इन विलोपनों की पहचान कर सकते हैं। उपरोक्त तरीकों से पता न चलने वाले मामलों में, UBE3A जीन अनुक्रमण अतिरिक्त 11% मामलों में उत्परिवर्तन की पहचान कर सकता है।