ईएमडीआर थेरेपी में आमतौर पर तीन मुख्य चरण शामिल होते हैं:
1. पिछली अनुभवों से उत्पन्न परेशान करने वाली यादों को संसाधित करना और हल करना।
2. वर्तमान ट्रिगर्स या तनाव कारकों के प्रति असंवेदनशीलता विकसित करना।
3. भविष्य में बेहतर कार्यप्रणाली के लिए अनुकूल व्यवहार और कौशल विकसित करना और एकीकृत करना।