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स्पाइना बिफिडा का निदान गर्भावस्था के दौरान किए गए नियमित अल्ट्रासाउंड परीक्षणों के माध्यम से शुरुआती चरणों में किया जा सकता है। गर्भावस्था के दौरान एमनियोटिक द्रव का विश्लेषण और एमनियोटिक द्रव में असामान्य वृद्धि भी निदान प्रक्रिया में महत्वपूर्ण संकेतक हैं। प्रसवोत्तर अवधि में, स्पष्ट लक्षणों की निगरानी या छिपे हुए संकेतों की जांच भी निदान के लिए महत्वपूर्ण है। एक न्यूरोसर्जन द्वारा नैदानिक जांच के बाद, स्पाइना बिफिडा के संदिग्ध मामलों वाले रोगियों में मैग्नेटिक रेजोनेंस (एमआर) और कंप्यूटेड टोमोग्राफी (सीटी) जैसे रेडियोलॉजिकल इमेजिंग तरीकों का उपयोग करके निदान की पुष्टि की जाती है।