हार्मोनल उपचारों के प्रभाव रोगी के लिंग, दिए गए उपचार के प्रकार और व्यक्तिगत कारकों के आधार पर भिन्न हो सकते हैं।

महिलाओं के लिए: हार्मोनल थेरेपी के कारण होने वाला रजोनिवृत्ति (मेनोपॉज) अक्सर अस्थायी होता है। हालांकि, ऐसी स्थितियों में जैसे प्राकृतिक रजोनिवृत्ति के करीब उपचार शुरू करना, अंडाशय को शल्य चिकित्सा द्वारा हटाना, या अंडाशय पर विकिरण चिकित्सा, रजोनिवृत्ति स्थायी हो सकती है।

पुरुषों के लिए: हार्मोनल उपचारों से यौन अक्षमता (इरेक्टाइल डिस्फंक्शन) जैसे दीर्घकालिक दुष्प्रभाव हो सकते हैं। प्रोस्टेट कैंसर के लिए दी जाने वाली कुछ हार्मोनल थेरेपी में, उपचार बंद करने के 3 से 12 महीने के भीतर यौन अक्षमता अक्सर ठीक हो सकती है। हालांकि, यदि दोनों अंडकोषों को शल्य चिकित्सा द्वारा हटा दिया जाता है (द्विपक्षीय ऑर्किडक्टोमी), तो यौन अक्षमता स्थायी होगी।