एमनियोसेंटेसिस को आमतौर पर एक सुरक्षित चिकित्सा प्रक्रिया माना जाता है। हालांकि, किसी भी आक्रामक प्रक्रिया की तरह, इसमें संक्रमण और एमनियोटिक द्रव के रिसाव जैसे बहुत दुर्लभ संभावित जोखिम होते हैं।