बोन मैरो बायोप्सी आमतौर पर बेहोशी की दवा (सेडेशन) के तहत की जाती है, जिसका अर्थ है कि अधिकांश रोगियों को प्रक्रिया के दौरान कोई दर्द या बेचैनी महसूस नहीं होती है। यदि प्रक्रिया स्थानीय एनेस्थीसिया के तहत की जाती है, तो सुई आगे बढ़ने पर रोगी को हल्का दबाव, खिंचाव या संक्षिप्त, हल्का दर्द महसूस हो सकता है। बायोप्सी के बाद, प्रक्रिया किए गए क्षेत्र में हल्का हड्डी में दर्द होना सामान्य है। ऐसे दर्द को आमतौर पर बिना पर्ची के मिलने वाली दर्द निवारक दवाओं से आसानी से नियंत्रित किया जा सकता है और यह आमतौर पर कुछ दिनों के भीतर अपने आप ठीक हो जाता है।