पॉलीप्स को कोलोनोस्कोपिक रूप से हटाने के बाद, प्राथमिक संभावित जटिलता प्रक्रिया स्थल पर रक्तस्राव है। इस रक्तस्राव को आमतौर पर आगे की कोलोनोस्कोपिक हस्तक्षेप के माध्यम से प्रबंधित और रोका जा सकता है। अन्य संभावित जटिलताओं में संक्रमण और आंतों का छिद्रण शामिल हैं।