Des tumeurs œsophagiennes peuvent se développer au niveau du cou, dans la portion thoracique de l'œsophage et à la jonction œsogastrique inférieure. On observe également des diverticules œsophagiens, des poches qui se forment dans l'œsophage, tels que le diverticule de Zenker au niveau du cou, des diverticules médio-thoraciques et épiphréniques en portion inférieure, des hernies hiatales géantes (où plus du tiers de l'estomac se trouve dans le thorax), l'achalasie et d'autres troubles de la motilité, des spasmes œsophagiens, des sténoses et des brûlures œsophagiennes, des perforations œsophagiennes et des fistules trachéo-œsophagiennes.