L'achalasie est un trouble de la déglutition (dysphagie) résultant de l'incapacité de l'anneau musculaire situé à l'extrémité inférieure de l'œsophage (sphincter œsophagien inférieur - SOI) à se relâcher, et du manque de mouvement coordonné des muscles œsophagiens (perte de péristaltisme). Chez une personne en bonne santé, les aliments avalés sont propulsés vers l'estomac par les contractions rythmiques des muscles de l'œsophage (péristaltisme). Le SOI, situé à la jonction de l'œsophage et de l'estomac, se relâche pendant la déglutition, permettant le passage des aliments dans l'estomac et empêchant leur reflux. Chez les patients atteints d'achalasie, ce processus naturel est perturbé en raison de lésions des cellules nerveuses de l'œsophage. Alors que le SOI ne parvient pas à se relâcher adéquatement, les mouvements contractiles de l'œsophage ne peuvent pas non plus se produire efficacement. Cette condition empêche le passage des aliments solides et liquides vers l'estomac, entraînant leur accumulation dans l'œsophage. Au fil du temps, l'œsophage peut se dilater, et les aliments fermentés accumulés à l'intérieur peuvent remonter dans la bouche avec un goût amer (régurgitation).