Les causes exactes des tumeurs du thymome ne sont pas encore entièrement comprises. Cependant, certaines études suggèrent que l'exposition à la radiothérapie et l'infection par le virus d'Epstein-Barr (EBV) à un jeune âge pourraient être des facteurs de risque potentiels. De plus, des recherches sont en cours pour déterminer si le thymome est une maladie génétique et pour clarifier la relation entre le thymome et les structures chromosomiques.