Avant de décider d'une chirurgie de remplacement du genou, l'état de santé général du patient est évalué, et les examens nécessaires tels que la médecine interne et la cardiologie sont effectués pour vérifier toute condition médicale supplémentaire. La décision de l'opération est prise après une évaluation complète de toutes les plaintes et problèmes de santé du patient. Comme toutes les procédures chirurgicales, la chirurgie de remplacement du genou comporte ses propres risques spécifiques.

L'infection est l'un des risques les plus courants et indésirables qui peuvent être rencontrés lors des chirurgies de remplacement du genou.
Le risque de formation de caillots sanguins dans les veines (thrombose veineuse profonde) est inférieur à 1 %. Pour minimiser ce risque, les patients sont mobilisés peu après l'opération et commencent les exercices. De plus, des appareils spéciaux soutenant la circulation veineuse peuvent être utilisés, et des médicaments anticoagulants ainsi que des bas de contention sont appliqués pour prévenir la formation de caillots.
Parmi les risques à long terme figure l'usure de la prothèse.