L'objectif principal du traitement du spina bifida est de refermer l'ouverture de la moelle épinière. Ceci est généralement réalisé par une intervention chirurgicale. Le spina bifida présentant un large spectre clinique, une approche multidisciplinaire est essentielle pour son traitement. La collaboration de diverses spécialités médicales pour l'élaboration d'un plan de traitement améliore considérablement la qualité de vie des patients.

Dans les formes plus légères de la maladie, le traitement se concentre sur l'atténuation des symptômes et la réduction des effets de la maladie. Dans ces cas, la physiothérapie et la médication peuvent être utilisées. De plus, les patients peuvent nécessiter des thérapies de soutien continues tout au long de leur vie pour prévenir et gérer les complications potentielles.